1.Dong Cao, Guangji Ye, Yuan Zong, Bo Zhang, Wenjie Chen(通讯作者), Baolong Liu, Huaigang Zhang(2018). Diversity and distribution of Rc1 alleles in Triticum urartu from the Middle East. Genetic Resources and Crop Evolution, 65(2): 637-644.
2.Dong Cao, Hongxia Wang, Bo Zhang, Baolong Liu, Dengcai Liu, Wenjie Chen(通讯作者), Huaigang Zhang(2018). Genetic diversity of avenin-like b genes in Aegilops tauschii Coss. Genetica, 146(1): 45-51.
3.Amy M. LaFountain, Wenjie Chen(共同第一作者), Wei Sun, Shilin Chen, Harry A. Frank, Baoqing Ding, YaoWu Yuan(2017). Molecular basis of overdominance at a flower color locus. G3: Genes|Genomes|Genetics, 7(12): 3947-3954.
4.Di Liu, Wenjie Chen(共同第一作者), Bo Zhang, Dengcai Liu, Baolong Liu, Huaigang Zhang(2016). Diversity and distribution of Puroindoline-D1 genes in Aegilops tauschii. Genetic Resources and Crop Evolution, 63(4): 615-625.
5.Bo Zhang, Wenjie Chen(共同第一作者), Baolong Liu, Lianquan Zhang, Deyong Zhao, Yuancan Xiao, Dengcai Liu, Huaigang Zhang(2014). Comparison of Grain Zinc and Iron Concentration between Synthetic Hexaploid Wheats and Their Parents. Agricultural Sciences, 5, 1433-1439.
6.Wenjie Chen(第一作者), Xing Fan, Bo Zhang, Baolong Liu, Zehong Yan, Lianquan Zhang, Zhongwei Yuan, Youliang Zheng, Huaigang Zhang, Dengcai Liu(2012). Novel and ancient HMW glutenin genes from Aegilops tauschii and their phylogenetic positions. Genetic Resources and Crop Evolution, 59(8):1649-1657.
7.Wenjie Chen(第一作者), Zhongwei Yuan, Lianquan Zhang, Xing Fan, Zehong Yan, Jirui Wang, Youliang Zheng, Huaigang Zhang, Dengcai Liu(2012). Novel HMW glutenin genes from Aegilops tauschii and their unique structures. Genes & Genomics, 34(3): 339-343.

1、国家重点研发计划项目“主要农作物品质性状形成的分子基础（ 2016YFD0100500 ）” 第二课题《小麦加工、营养和淀粉品质形成与改良的分子基础》（2016YFD0100502）。2016/01-2020/12，研究任务负责人。
2、中国科学院战略性先导科技专项（A类）-分子模块设计育种创新体系子课题（XDA08030106）：高产优质小麦新品种分子设计与培育。2013/08-2018/08，子课题联系人。
3、中国科学院“西部之光”人才培养计划“西部博士资助项目”，节节麦类燕麦贮藏蛋白基因的遗传分化及其与地理分布的关系，2014/01-2016/12，课题负责人。
4、青海省自然科学基金青年项目，2013-Z-942Q、春小麦对青海高原不同生态环境响应的分子机理研究、2013/01-2015/12，课题负责人。
5、青海省高原作物种质资源创新与利用重点实验室开放课题，节节麦新型HMW-GS亚基组合1Dx3.1t+1Dy11*t在小麦育种中的应用评价、2013/01-2015/12，课题负责人。